畢業總學分規定24學分 並完成碩士論文，包括：專業必修4學分、專業選修至少20學分
必修課程
| 第一學年(上) | 學分 | 時數 | 第一學年(下) | 學分 | 時數 |
|---|---|---|---|---|---|
|
書報討論 (一) |
1 | 2 | 書報討論 (二) Seminar II |
1 | 2 |
| 化學研究技術 | 2 | 4 | |||
| 第二學年(上) | 學分 | 時數 | 第二學年(下) | 學分 | 時數 |
選修課程
| 課程名稱 | 學分 | 課程名稱 | 學分 | 課程名稱 | 學分 | 課程名稱 | 學分 |
| 高等有機化學 | 3 | 高等無機化學 | 3 | 高等物理化學 | 3 | 高等分析化學 | 2 |
| 有機光電材料 | 3 | 半導體製程與設備概論 | 3 | 分子模擬 | 3 | 質譜分析技術 | 2 |
| 高等有機合成化學 | 3 | 薄膜製備與分析 | 3 | 高效能計算概論 | 3 | 生化分析技術 | 3 |
| 新合成方法 | 3 | 薄膜製備與分析 | 3 | 蝕刻製程 | 2 | 光譜化學分析 | 3 |
| 當代有機金屬化學 | 3 | 先進材料設計與製備技術 | 3 | 真空技術 | 3 | 奈米製程 | 3 |
| 有機金屬化學 | 3 | 無機光譜學 | 3 | 表面處理技術 | 3 | 分離科學 | 3 |
| 有機化學特論 | 3 | 無機材料之應用 | 3 | 半導體微影製程概論 | 3 | 微量生物分析 | 3 |
| 有機合成反應回顧討論 | 3 | 發光二極體技術概論 | 2 | 儲能電池技術 | 3 | 層析實作與應用 | 3 |
| 高分子科學概論 | 3 | 材料分析 | 3 | 計算化學 | 3 | 毛細電泳實作與應用 | 3 |
| 有機光譜分析與實作 | 3 | 應用電化學 | 3 | 應用光化學 | 3 | 質譜學 | 3 |
| 應用有機化學概論 | 3 | 奈米科技與應用 | 3 | 化學數學 | 3 | 分離技術 | 3 |
| 有機逆合成 | 3 | 化學研究(一)(二) | 3 | 食品暨藥物檢驗 | 3 |
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